姓名：马园园

职称：教授

最高学位：管理学博士

所属硕点：电子信息

所在院系：suncitygroup太阳集团

邮箱：115422504@qq.com

专业方向：计算机科学与技术

研究方向：微生物多组学，单细胞多组学，机器学习。

个人简介：

    马园园，男，1983.11，出生于河南省许昌市，博士研究生学历，教授。2018年6月博士毕业于华中师范大学管理科学与工程专业，2020.10—2021.11于香港中文大学开展单细胞多组学研究。承担《机器学习》、《python编程实践》、《计算机专业英语》等课程的教学工作。主要从事生物信息学、微生物多组学、单细胞大数据等方向的研究工作。以第一作者/通讯作者在微生物组学数据挖掘和单细胞多组学数据挖掘等方面公开发表学术论文30余篇，其中20篇SCI收录论文，主编3本著作；主持教育部人文社科项目、省自然科学基金等部省级项目4项；积极参与学术服务，担任了IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (IEEE BIBM，CCF B类会议)程序委员会委员，担任了Nature Communication、Briefings in Bioinformatics等多个国际期刊的编委、审稿等工作。

代表性成果：

1. Ma Y, Luo M X, Yan L, Ma Y*. Variational Bayesian Multi-Kernel Adaptive Deep Fusion for Microbe-Related Drug Prediction[J]. Journal of Chemical Information and Modeling, 2026.

2. Ma Y, Liu L. Hypergraph contrastive learning with optimal transport: an effective hypergraph contrastive learning framework for deciphering complicated microbe-drug interaction relationships[J]. PeerJ Computer Science, 2026, 12: e3662

3. Ma Y, Liu L. NMFGOT: a multi-view learning framework for the microbiome and metabolome integrative analysis with optimal transport plan[J]. npj Biofilms and Microbiomes, (SCI)

4. Ma Y, Liu L, Zhao Y, et al. HyperGCN: an effective deep representation learning framework for the integrative analysis of spatial transcriptomics data[J]. BMC genomics, 2024. (SCI)

5. Zhang J, Lu H, Jiang Y, Ma Y, et al. ncRNA coding potential prediction using BiLSTM and transformer encoder-based model[J]. Journal of Chemical Information and Modeling, 2024. (SCI)

6. Ma Y, Liu L, Ma Y, et al. HONMF: integration analysis of multi-omics microbiome data via matrix factorization and hypergraph. Bioinformatics, 2023. (SCI)

7. Zhao Y, Ma Y*, Zhang Q. Metabolite-disease interaction prediction based on logistic matrix factorization and local neighborhood constraints. Frontiers in Psychiatry, 2023. (SCI)

8. Ma Y, Sun Z, Zeng P, et al. JSNMF enables effective and accurate integrative analysis of single-cell multiomics data. Briefings in Bioinformatics, 2022. (SCI)

9. Ma Y, Liu L, Chen Q, et al. An inductive logistic matrix factorization model for predicting drug-metabolite association with vicus regularization. Frontiers in Microbiology, 2021. (SCI)

10. Ma Y, Zhao J, Ma Y. MHSNMF: multi-view hessian regularization based symmetric nonnegative matrix factorization for microbiome data analysis. BMC Bioinformatics, 2020. (SCI)

11. Ma Y, Liu G, Ma Y, et al. Integrative analysis for identifying co-modules of microbe-disease data by matrix tri-factorization with phylogenetic information. Frontiers in Genetics, 2020. (SCI)

12. Ma Y, Hu X, He T, et al. Clustering and integrating of heterogeneous microbiome data by joint symmetric nonnegative matrix factorization with laplacian regularization. IEEE Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2017. (SCI)

13. Ma Y, Hu X, He T, et al. Hessian regularization based symmetric nonnegative matrix factorization for clustering gene expression and microbiome data. Methods, 2016. (SCI)

科研项目：

1. 主持，湖北省自然科学基金联合基金项目，基于多组学数据与人工智能的糖尿病早期预警方法及个体化研究，项目编号：2025AFD084.

2. 主持，湖北省教育科学规划重点课题，美育浸润校园指标体系构建、测度与提升路径研究，项目编号：2024GA095.

3. 主持，湖北省教育厅科学研究计划重点项目, 项目编号：D20232604.

4. 主持，教育部人文社科项目，基于多视角学习的甲骨卜辞语义网络融合模型与应用研究，项目编号20YJC740042.

5. 主持，河南省科技攻关项目，基于多组学时间序列数据的微生物与人类疾病关系研究，基金编号202102310561.

6. 主持，河南省教育厅自然科学基金项目，基于多组学数据的微生物动态网络模式提取与分析关键技术研究，基金编号20B520002.

著作：

1. 马园园. 基于矩阵分解的信息融合方法与应用. 科学技术文献出版社, 2019年7月出版；

2. 马园园. 基于多视角学习的甲骨卜辞语义网络融合方法与应用研究. 科学技术文献出版社，2023年9月出版。

荣誉：

1. 2025年获湖北省科技进步奖二等奖（排5）；

2. 2022年获得河南省教育厅优秀科技论文二等奖（第一）；

3. 2019年获得安阳市自然科学论文一等奖（第一）。

工作经历：

2023.04—至今，湖北文理学院

2006.07-2023.04，安阳师范学院，其中2020.10-2021.11，于香港中文大学从事博士后副研究员工作

教育经历：

2002.09-2006.06，华中师范大学信息管理学院， 管理学学士

2009.09-2012.07，河北工程大学计算机学院，工程硕士

2015.09-2018.06， 华中师范大学信息管理学院， 管理学博士

招生意愿：

欢迎在人工智能、生物医学大数据分析、智慧健康等领域感兴趣的同学加入。